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El cerdo ibérico presenta una gran variabilidad, lo que se traduce en la existencia de varias estirpes dentro de ella.
Hasta el momento, la diferenciación entre estas estirpes se ha basado principalmente en caracteres morfológicos y fanerópticos. Sin embargo, hoy en día esta diferenciación puede estudiarse desde el punto de vista genético, utilizando herramientas de genética molecular.
Diversos trabajos han demostrado que los marcadores moleculares de tipo microsatélite son una herramienta de gran valor en estudios de diferenciación genética de poblaciones animales.
El objetivo de este trabajo fue poner de manifiesto las relaciones genéticas existentes entre las diferentes estirpes y líneas tradicionalmente reconocidas en el cerdo ibérico, utilizando marcadores microsatélites.
Materiales y métodos
Para este estudio utilizaron 350 animales de la raza porcina ibérica, representativos de las siguientes estirpes: Entrepelado, Negro Lampiño, diversas líneas de Retinto (Villalón, Silvela, Valdesequera y Mamellado), Torbiscal, así como otras variedades como el cerdo Alentejano, el Manchado de Jabugo y el Negro de los Pedroches. Además, se incluyeron muestras de 30 animales de la raza Duroc, utilizadas como grupo de referencia debido a su importancia como raza parental en los cruzamientos que se realizan con el cerdo ibérico, de acuerdo con la Norma de Calidad.
Las muestras consistieron en sangre entera extraída del seno infraorbitario, utilizando sistemas Vacutainer en tubos de 7 ml que contenían EDTAK3 como anticoagulante.
La extracción del ADN se llevó a cabo siguiendo la metodología mediante digestión con proteinasa K. Todos los animales fueron genotipados utilizando un total de 35 marcadores microsatélites distribuidos a lo largo del genoma porcino, entre los que se incluyen los 25 marcadores recomendados por la FAO para este tipo de estudios.
Los marcadores microsatélites fueron amplificados mediante PCR múltiple (Reacción en Cadena de la Polimerasa). Los fragmentos amplificados fueron verificados en gel de agarosa al 2% y posteriormente analizados en un secuenciador automático capilar. La tipificación de los alelos se realizó con el software GeneMapper.
Para el análisis de la variabilidad genética y la diferenciación poblacional, se utilizó el software Genetix. La proximidad genética entre las diferentes poblaciones analizadas se determinó mediante el cálculo de la matriz de distancia de Reynolds, representada a través del algoritmo Neighbor Joining con el software Phylip.
Resultados y discusión
El número medio de alelos por locus en cada población osciló entre 2,25 y 2,54 en las poblaciones Manchado de Jabugo y Villalón, respectivamente, y alcanzó un valor de 4,8 en la raza Duroc (tabla 1).
Al calcular las heterocigosidades observada (Ho) y esperada (He), constataron nuevamente que Manchado de Jabugo y Villalón fueron las poblaciones con los valores más bajos, lo que indica una menor variabilidad genética y, por tanto, mayor consanguinidad. En contraste, la población Negro de los Pedroches presentó los valores de heterocigosidad más elevados, reflejando una mayor diversidad genética.
En cuanto a los estadísticos F de Wright (tabla 2), los valores medios de FST entre todas las poblaciones, así como entre todos los pares (tabla 3), fueron muy elevados, lo que indica que aproximadamente un 20% de la variación genética total se debe a diferencias entre poblaciones. Este valor es superior al reportado en otras razas de animales domésticos, lo que sugiere una fuerte diferenciación genética entre las estirpes analizadas.
La población Manchado de Jabugo mostró el mayor grado de diferenciación genética en comparación con las demás estirpes, incluso mayor que la observada entre la raza Duroc y las estirpes ibéricas, lo que subraya su singularidad genética.
La tabla 3 también presenta los valores del número de migrantes por generación (Nm) entre las poblaciones estudiadas. El flujo génico más alto se observó entre las poblaciones Mamellado y Silvela, lo que indica una mayor conectividad genética entre ellas.
La representación de las distancias genéticas de Reynolds en forma de árbol enraizado (figura 1) reveló una agrupación clara de los animales en 3 grandes grupos poblacionales:
- Grupo duroc: Aislado genéticamente del resto.
- Grupo manchado de Jabugo: Separado distintivamente de las demás estirpes ibéricas.
- Grupo de estirpes del cerdo ibérico: Que agrupa al resto de las poblaciones.
Esta diferenciación del Manchado de Jabugo respecto a las demás estirpes del cerdo ibérico ya ha sido evidenciada en estudios previos con ADN mitocondrial, donde se identificaron haplotipos de origen asiático ausentes en las otras estirpes.
Dentro del grupo de estirpes del cerdo ibérico se distinguen 2 subgrupos:
- Por un lado, la población Negro de los Pedroches.
- Por otro, un grupo que incluye estirpes con influencias de 2 líneas principales:
- Sangre Lampiña: Lampiño y Torbiscal.
- Sangre Retinta: Alentejano, Valdesequera, Mamellado, Silvela, Entrepelado y Villalón.
Las poblaciones Silvela, Mamellado y Villalón se agrupan conjuntamente debido a su origen común. Asimismo, Valdesequera procede de Silvela, y el Entrepelado es resultado de cruzamientos con el Retinto Extremeño.
Conclusiones
- La raza Duroc y la población Manchado de Jabugo se encuentran claramente diferenciadas, tanto entre sí como con respecto al resto de las estirpes y líneas del cerdo ibérico.
- Las estirpes y líneas del cerdo ibérico conforman un grupo genéticamente bien definido, aunque presentan un elevado nivel de diferenciación genética interna, lo cual respalda la diversidad intra-racial reconocida dentro de esta raza.
Autores:
Membrillo, A., Azor, P.J., Clemente, I., Gómez, J., Jiménez, A., Santos, E., y Molina, A.
Departamento de Genética, Facultad de Veterinaria, Universidad de Córdoba. España.
Dorado, G.
Departamento de Bioquímica y Biología Molecular, Universidad de Córdoba. España.
Diéguez, E.
Asociación Española de Criadores de Ganado Porcino Selecto Ibérico Puro y Tronco Ibérico. Zafra. España.
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